1 - La maladie et l’épidémie​

Présentation clinique

Classe d’âge des cas 
10 ans =1% ; 10-19 ans=1% ; 20-29 ans=8% ; 30-79 ans= 87% ; ≥ 80 ans= 3%.

 

Symptomatologie polymorphe
Signes infectieux (fièvre, frissons) et signes respiratoires (toux, dyspnée).
Fréquence des signes extra-respiratoires survenant notamment en tout début d’infection et constituant des éléments d’orientation diagnostique si de survenue brutale 
HCSP – Préparation des épidémies de virus hivernaux en période de circulation du SARS-CoV-2 – 4 octobre 2020
Académie de médecine – Symptômes inhabituels devant faire rechercher une Covid-19 – 17 juin 2020

– En population générale: asthénie inexpliquée, myalgies inexpliquées, céphalées, anosmie ou hyposmie, agueusie ou dysgueusie
– Chez les personnes de plus de 80 ans: altération de l’état général, chutes répétées, apparition ou aggravation de troubles cognitifs, syndrome confusionnel, diarrhée, décompensation d’une pathologie antérieure
– Chez les enfants: tous les signes cités en population générale, altération de l’état général, diarrhée, fièvre isolée chez l’enfant de moins de 3 mois
– En situation d’urgence: troubles du rythme cardiaque récents, atteintes myocardiques aigües, évènement thromboembolique grave.
HCSP. Avis relatif aux signes cliniques d’orientation diagnostique du Covid-19 – 20 avril 2020 

 

Personnes asymptomatiques
Des approches méthodologiques complexes ont estimé que la fraction des « infectés non répertoriés » (qui inclut des sujets asymptomatiques) serait de 86% (95% CI: [82%-90%]).
Dans une étude sur l’investigation du bateau de croisière Diamond Princess, le pourcentage de cas asymptomatiques a été estimé à 17,9% (95% CrI : 15.5–20.2%)
HCSP. 4.2. Formes pauci-symptomatiques ou asymptomatiques (page 9) – 8 avril 2020

Sévérité

Formes modérées = 81%
Formes sévères = 14% (dyspnée, fréquence respiratoire ≥30/mn, SaO2≤ 93%, PiO2 <300, et/ou infiltrat pulmonaire > 50% en 24-48h),
Formes critiques = 5% (SDRA, choc septique, et/ou défaillance multiviscérale)

HCSP. 4.1.1 Présentation clinique (page 7) – 5 mars 2020

Transmission

Transmission par inhalation de gouttelettes suite à éternuements ou toux. Virus présent dans les voies aériennes supérieures et potentiellement inférieures.
Transmission vers les mains possible mais non prouvée.
Surfaces contaminées : survie 3 heures (surfaces inertes sèches) à 6 jours (milieu humide).
Transmission fécale non documentée. Virus présent dans les selles même après disparition des symptômes.
Transmission possible par personnes asymptomatiques.
SPF – Conduite à tenir en cas de suspicion de réinfection- 21 avril 2021
SPF – Conduite à tenir concernant un nouveau variant détecté en Bretagne (variant du clade 20C) – 16 mars 2021
HCSP – Risque de transmission du virus SARS-CoV-2 par les activités liées au tabagisme et au vapotage – 15 janvier 2021
DGS-Urgent n°2021_05 : Nouvelles variantes Sars-Cov2 : Conduite à tenir – janvier 2021
Inserm. Le risque de transmission par porteurs sains confirmé – 1er avril 2020
HCSP. 3. Point sur les modes de transmission (page 4) – 5 mars 2020
NEJM. Aerosol and surface stability of SARS-Cov-2. 17 mars 2020

 

Contagiosité
Indice de reproduction de base (R0) entre 2 et 3 : transmissibilité supérieure à celle de la grippe saisonnière.
HCSP. 3. Points sur les modes de transmission (page 4) – 5 mars 2020

Le clone anglais « VUI-UK »  : anticiper une reprise épidémique en Janvier
Note d’alerte du Conseil scientifique – 23 décembre 2020

Transmission présymptomatique possible 6 jours avant le début des symptômes.
HCSP. 4.2. Formes pauci-symptomatiques ou asymptomatiques (page 8) – 5 mars 2020

Evolution naturelle

Incubation de 4 à 4,9 jours, toutefois apparition des symptômes possible entre 2 à 14 jours après exposition.
HCSP. 4. Clinique (page 2) – 8 avril 2020

 

Temps médian de guérison clinique
Deux semaines pour les formes peu sévères
3 à 6 semaines pour les formes graves
Report of the WHO-China Joint Mission on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). 2020

 

SDRA
Survenue dans 17,6 à 29% des cas.
Délai de survenue = 9 jours
HCSP. 4.1.1 Présentation clinique (page 7) – 5 mars 2020

 

Formes compliquées
– Aggravation vers le 7ème jour avec atteinte parenchymateuse, sepsis, surinfections bactériennes ou fongiques.
– 
Cliniquement : dyspnée vers J8 et détresse respiratoire vers J9.
Radiologiquement : pneumopathie en verre dépolie, unilatérale préférentiellement sur le lobe inférieur droit, puis bilatérale.
HCSP. 4.1.1 Présentation clinique (page 7) et 4.5.4 Anomalies radiologiques (page 12) – 5 mars 2020

 

Forme prolongée
HAS – Symptômes prolongés suite à une Covid-19 de l’adulte – Diagnostic et prise en charge – 12 février 2021

 

Principaux facteurs de risque d’évolution défavorable selon la littérature
– Âge : mortalité = 0% chez les moins de 9 ans, 8% chez les patients âgés de 70-79 ans, 14,8% chez les patients 80 ans.
– 
Comorbidité : HTA, pathologie cardiovasculaire, diabète, maladie vasculaire cérébrale.
– 
Critère clinique majeur : saturation en oxygène mesurée avec une oxymétrie de pouls (Sp02) < 95% en air ambiant (en l’absence d’affection respiratoire chronique hypoxémiante) 
– Polypnée (fréquence respiratoire > 24 cycles /minute au repos) 
– Chute de la pression artérielle systolique < 100 mm Hg (en l’absence de prise d’antihypertenseurs)
– Altération brutale de l’état général ou de la vigilance chez le sujet âgé.
HCSP. 2.3 Facteurs de risque d’évolution défavorable (page 5) – 8 avril 2020

Guérison

NB. Une toux irritative peut persister.

 

Population générale
Au moins 8 jours après le début des symptômes
ET au moins 48h après disparition de la fièvre
ET au moins 48h après disparition de la dyspnée.
Pendant encore 7 jours, éviter les contacts rapprochés avec personnes fragiles.

 

Immunodéprimés
Au moins 10 jours après le début des symptômes
ET au moins 48h après disparition de la fièvre
ET au moins 48h après disparition de la dyspnée.
Pendant encore 14 jours, port du masque chirurgical lors de la reprise des activités professionnelles.

 

Soignants sans risque de forme grave
Au moins 8 jours après le début des symptômes
ET au moins 48h après disparition de la fièvre
ET au moins 48h après disparition de la dyspnée.
Pendant encore 7 jours, port du masque chirurgical lors de la reprise des activités professionnelles.

 

Soignants avec risque de forme grave
Au moins 10 jours après le début des symptômes
ET au moins 48h après disparition de la fièvre
ET au moins 48h après disparition de la dyspnée.
Pendant encore 7 jours, port du masque chirurgical lors de la reprise des activités professionnelles (14 jours pour les patients immunodéprimés).

 

Soignants ayant développé une forme grave de Covid-19
Critère virologique.
Ministère des solidarités et de la santé. Lignes directrices pour la prise en charge en ville (paragraphe 3) – 20 avril 2020

 

Cas asymptomatiques 
10 jours après le prélèvement RT-PCR+
Ministère des Solidarités et de la Santé. Stratégie de « contact-tracing isolement », en complément des mesures de distanciation (page 5 à 8) – 6 mai 2020
Ministère des Solidarités et de la Santé -Doctrine de mise en œuvre du « Contact tracing » – extrait des instructions ministérielles – 13 mai 2020 

 

Définition de cas de réinfection
SPF – Définition de cas de réinfection au SARS-CoV-2 – 23 décembre 2020

NDLR. Les patients guéris sont en principe immunisés. En l’absence de donnés spécifiques sur le sujet, il semble nécessaire de poursuivre l’application des mesures barrières.

Létalité

Létalité globale = 2,3%
Ce taux de létalité a été calculé sur les cas confirmés. Il ne tient pas compte des « infectés non répertoriés », c’est-à-dire les malades qui n’ont pas eu de test PCR. Des approches méthodologiques complexes ont estimé que la fraction des « infectés non répertoriés » serait de 86% (95% CI: [82%-90%]).
HCSP. 4. Clinique (page 5) – 5 mars 2020

 

Mortalité = 0% chez les moins de 9 ans, 8% chez les patients âgés de 70-79 ans, 14,8% chez les patients 80 ans.
HCSP. 4.5 Facteurs de risque d’évolution défavorable (page 11) – 5 mars 2020

Evolution de l’épidémie

Stratégie de lutte : casser les chaines de transmission

La politique est maintenant de vacciner, tout en continuant le dépistage à grande échelle et l’isolement des personnes détectées.
Chez une personne contact à risque, la période de quarantaine est allégée de 14 jours à 7 jours en cas de test RT-PCR négatif à 7 jours du dernier contact avec le cas.
HAS – Face aux variants émergents, vacciner de manière réactive – 22 juin 2021
Ameli – Mise en place du rétrotracing dans toute la France début juillet -17 juin 2021
HCSP – Contact tracing et mesures barrières pour les personnes complètement vaccinées : seulement si personne à risque de forme grave non vaccinée ou personne fortement immunodéprimée – 16 juin 2021
Conseil scientifique COVID – Utilisation d’un pass sanitaire lors de grands rassemblements – 3 mai 2021
HAS  – Pas de limite d’âge pour l’utilisation des tests antigéniques sur prélèvement nasal – 26 avril 2021
JORF – Test et autotests itératifs (texte n°20) – 27 mars 2021
Ministère de la Santé – Tous les avis du Conseil scientifique Covid-19 et son règlement intérieur – 16 mars 2021
Ministère de la Santé – Réalisation d’une PCR de criblage, 10 jours d’isolement avec test avant la sortie – 7 février 2021
Ameli – Cas contact algorithme de la conduite suite à l’apparition des variants – 7 février 2021
HCSP – Contrôle de la diffusion des nouveaux variants du virus -28 janvier 2021
JORF – Modification de contact covid pour les personnes infectées ou personnes contact ou co-exposées présentant un risque d’infection – 20 janvier 2021
JORF – Mesures générales nécessaires pour faire face à l’épidémie dans le cadre de l’état d’urgence sanitaire- Décret n° 2021-31 – 15 janvier 2021
DGS – Eviter la propagation des variantes du SARS-CoV-2 – communiqué de presse – 7 janvier 2021
DGS – Urgent – Durée d’isolement et de quarantaine des cas confirmés de Covid-19 et des personnes contact à risque – 29 septembre 2020
Départements en zone rouge : qu’est-ce que ça change ?
JORF – Avis sur le suivi numérique des personnes (texte n°50) – 3 mai 2020
Ministère de la Santé – Confinement et critères de sortie. Avis du Conseil scientifique – 20 avril 2020
Ministère de la Santé. Guide méthodologique COVID-19 – Préparation a la phase épidémique. Etablissements de santé, médecine de ville et EMS (Page 14) – 16 mars 2020


Depuis le confinement
JORF – texte 14 – 20 mars 2021


Pour faire face à l’épidémie de covid-19

Des opérations collectives de dépistage par des tests rapides nasopharyngés d’orientation diagnostique antigéniques peuvent être autorisées
Le prélèvement naso-pharyngé peut être réalisé par un masseur-kinésithérapeute sous réserves
JORF n°0226 du 16 septembre 2020 (Texte n° 24)

Les tests salivaires peuvent compléter les tests nasopharyngés chez les personnes symptomatiques
HAS – communiqué de presse – 18 septembre 2020


« Contact Covid » téléservice élaboré par l’Assurance Maladie et accessible via Amelipro 

Il permet aux médecins d’enregistrer l’ensemble des informations concernant leur patient et les éventuels cas contacts qu’ils auraient recensés.
Le rôle dévolu au médecin qui reçoit le patient symptomatique est de recueillir sur Amelipro les données concernant le patient et les personnes qui vivent à son domicile. Ce travail peut être coté G+MIS (55 euros).
De façon optionnelle, le médecin peut choisir de recueillir aussi des données concernant les cas contacts hors domicile. La stratégie est illustrée en 3 fiches récapitulatives et téléchargeables.
L’Assurance Maladie et les ARS prennent le relais du dépistage, les résultats des tests PCR étant centralisés sur un système d’information national de suivi du dépistage (SI-DEP) avec un encadrement des données.
Fiches téléchargeables « J’ai les signes de la maladie » « J’ai été en contact » « Je limite les transmissions » 14 mai 2020
La protection des données personnelles – 13 mai 2020
Doctrine de mise en œuvre du « Contact Tracing » extrait des instructions ministérielles 13 mai 2020
Avis de la CNIL sur un projet de décret relatif aux systèmes d’information – 13 mai 2020
CNAM – Les médecins au cœur du circuit de « contact tracing » des patients COVID-19 – 2 mai 2020


Outil étapes clés parcours Covid-19
Calcule automatiquement la durée d’isolement en fonction de la date de début des signes ou du dernier contact avec le cas.
ARS IDF – Outil étapes clés parcours Covid-19

Vaccination

Données scientifiques
ANSM – Efficacité du vaccin chez les personnes âgées : réduction de risque de 87% au 7e jour suivant la seconde dose – 21 mai 2021
ANSM – Effets indésirables liés aux vaccins autorisés contre la COVID-19 : ce qu’il faut savoir – 30 avril 2021
HAS – Efficacité du vaccin AstraZeneca chez les personnes âgées – 2 mars 2021
New England Journal of Medicine – 11,1 cas d’anaphylaxie pour un million de doses du Comirnaty ® -30 décembre 2020
Revue Nature – Un guide de vaccinologie : des principes de base aux nouveaux développements – 22 décembre 2020

Recommandations
EMA – Spikevax (Moderna) autorisé à partir de 12 ans -23 juillet 2021
HCSP – Conditions de la mise en œuvre d’une éventuelle obligation vaccinale – 19 juillet 2021
HAS – Le vaccin Janssen pourrait être proposé aux Français de moins de 55 ans résidant à l’étranger dans le cadre d’une décision médicale partagée – 19 juillet 2021
HAS- L’obligation vaccinale prévue par la loi est justifiée – 16 juillet 2021
Public Sénat – Obligation vaccinale, passe sanitaire : ce que permettent les textes de loi -12 juillet 2021
HAS – Adapter la stratégie de vaccination pour faire face au variant delta – 9 juillet 2021
HAS – La HAS précise ses recommandations sur l’utilisation du vaccin Janssen chez les moins de 55 ans – 9 juillet 2021
Ameli – Obtenir la liste de ses patients non vaccinés – 8 juillet 2021
SPILF – Les infectiologues favorable à une obligation vaccinale pour le personnel de santé et les aidants au contact des personnes fragiles – 2 juillet 2021
HAS -Intensifier la vaccination des personnes vulnérables et précaires ainsi que des soignants, question de l’obligation vaccinale – 1er juillet 2021
Ministère de la Santé – Trod avant vaccination + 29 juin 2021
Ministère de la Santé – Portfolio vaccin – mise à jour du 29 juin 2021
HAS – Face aux variants émergents, vacciner l’ensemble de l’entourage des cas – 22 juin 2021
HCSP – Contact tracing et mesures barrières pour les personnes complètement vaccinées – 16 juin 2021
HAS -Vaccin à ARNm COMIRNATY® chez les 12-15 ans – 3 juin 2021
HAS  – Un TROD en parallèle de la 1ère dose de vaccin pour identifier les personnes qui ont déjà contracté la Covid-19 – 3 juin 2021
DGS Urgent – Administration d’une 3ème dose pour les personnes immunodéprimées et les jeunes de 16 et 17 ans à très haut risque de forme grave : nouveaux délais à respecter entre l’administration des deux doses de vaccins – 6 mai 2021
HAS – Ne pas reporter la seconde injection vaccin ARNm au-delà des 42j et si tension approvisionnement injecter un vaccin à ARNm différent de celui administré en première dose – 30 avril 2021
DGS Urgent – Ouverture de la vaccination a toutes les personnes souffrant de comorbidités de 18 à 49 ans – 30 avril 2021
HAS – Stratégie vaccinale : impact potentiel de la circulation des variants du SARS-CoV-2 sur la stratégie -22 avril 2021
DGS Urgent – Rappel à 6 semaines pour les vaccins à ARN et à 12 semaines pour AstraZeneca – 11 avril 2021
HAS – Stratégie de vaccination face aux variants du SARS-CoV-2 – 9 avril 2021
HAS – Pour les moins de 55 ans ayant déjà reçu une dose d’AstraZeneca, rappel avec vaccin à ARN – 9 avril 2021
Lecrat – Vaccins contre la COVID – Grossesse et allaitement – 18 mars 2021
HAS – Covid-19 : le vaccin de Janssen dans la stratégie vaccinale – 12 mars 2021
Infovac suisse – Vaccin et immunomodulateurs – 5 mars 2021
HAS – Actualisation des facteurs de risque de formes graves et recommandations sur la stratégie de priorisation vaccinale – 2 mars 2021
HAS – Utilisation chez les professionnels de santé et les personnes de 50 à 64 ans – 2 février 2021
Santé BD – Vaccin en langage facile à lire – 2 février 2021
Ameli – Téléservice Vaccin Covid – 25 janvier 2021
HAS – Report de la 2ème dose à 6 semaines, pour les deux vaccins à ARNm, afin d’accélérer l’administration de la première dose – 21 janvier 2021
CNGE – Données scientifiques du vaccin Moderna pour aider le patient à prendre une décision -20 Janvier 2021
HAS – Place du Vaccin Moderna Covid-19 mRNA – 8 janvier 2021
Société française d’Hygiène Hospitalière – Mesures de prévention du risque infectieux lors d’un acte de vaccination- 6 janvier 2021
Service public – Calendrier : prise de RV à partir du 14 janvier 2021 pour les + de 75 ans dans des centres de vaccination par téléphone et internet à partir de https://sante.fr/ – 7 janvier 2021
Mission Primo – Prévention sur les AES
HAS : Stratégie d’utilisation du vaccin Comirnaty ® -24 décembre 2020


En pratique
DGS – Commande des vaccins Moderna, Janssen et Astrazeneca sur https://declarations-pharmacie.ars.sante.fr
Ameli – Attestation de vaccination dite « certifiée » au format papier depuis le téléservice Vaccin Covid – 3 mai 2021
Collège de la Médecine Générale – Fiches pratiques pour les 4 vaccins disponibles – 29 avril 2021
INFOVAC-France – Comment vacciner en IM : avec une photo et rappel de ne pas aspirer, injecter rapidement, pas de gants …
CNAM – Vaccination contre la Covid-19 en équipe pluriprofessionnelle : création du forfait équipe – 30 mars 2021
CNAM – Commander des doses du vaccin AstraZeneca en médecine de ville : mode d’emploi – 30 mars 2021
HAS – Impliquer davantage de professionnels pour accélérer la campagne – 26 mars 2021
JORF – Vaccination en équipe en Centre de santé et en MSP : rémunération (texte n°18) forfaitaire – 24 mars
HAS – Vaccin AstraZeneca chez les 55 ans et plus – 19 mars 2021
DGS – Commande d’un flacon d’Astra Zeneca avant le 17 mars pour les MG ayant utilisé les doses reçues – 14 mars 2021
JORF – Vaccination autorisée par les sages-femmes, pharmaciens et IDE sauf exceptions (texte 31) – 5 mars 2021
Ameli – Vacciner les patients âgés de 50 à 74 ans inclus avec comorbidités en médecine de ville – 3 mars 2021
HAS – Vacciner plus vite les personnes les plus vulnérables : Astra Zeneca après 65 ans – 2 mars 2021
Ameli – Commander des doses du vaccin AstraZeneca – 1er mars 2021
HAS – Une seule dose de vaccin pour les personnes ayant déjà été infectées par le SARS-CoV-2 – 12 février 2021
DGS – Approvisionnement en flacons de vaccin covid-19 Astra Zeneca suspension injectable® des médecins de ville via une officine de référence – 12 février 2021
JORF Arrêté  – Rémunérations en centre de vaccination – 5 février 2021
Point sur la stratégie et les vaccins personnes à haut risques – 15 janvier 2021
Filières de Santé Maladies Rares – Vaccination en très haute priorité de pathologies rares
Manipulation illustrée du vaccin Cominarty – 9 janvier 2021
SPILF – Aiguilles et vaccin – 8 janvier 2021
European Medicines Agency – 6 doses autorisées avec un flacon (sous conditions d’utilisations) – 8 janvier 2021
DGS – Portefolio vaccination anticovid à destination des professionnels – 31 décembre 2020
CNAM – Nouvelle consultation de prévention de la contamination aux personnes vulnérables – 29 décembre 2020
DGS – Organisation de la vaccination en EHPAD et en USLD – 24 décembre 2020
HAS – Réponses rapides / Consultation de pré-vaccination en soins de premier recours – 24 décembre 2020
CNAM – le point sur la stratégie et les vaccins – 28 décembre 2020


Surveillance
ANSM – Point de situation sur la surveillance des vaccins contre la COVID-19
ANSM – Vaccins à ARNm contre la COVID-19 Cominarty et Spikevax : risque de myocardite et de péricardite à 14 jours – 23 juillet 2021
ANSM – Le vaccin Comirnaty (Pfizer-BioNTech) n’augmente pas le risque d’événements cardiovasculaires graves chez les personnes âgées de 75 ans et plus en France  – 19 juillet 2021
Institut Paul-Ehrlich – Les raisons détaillées des précaution de la suspension passée du vaccin AstraZeneca – 17 mars 2021

Nous ne sommes pas en capacité de répondre individuellement à chaque question mais nous intégrons régulièrement les réponses dans le site. Merci de votre compréhension.